Глава администрации Краснодара, Евгений Наумов, утвердил проект застройки зеленой зоны на набережной в Юбилейном микрорайоне, где планируется возведение храма Пресвятой Богородицы. В связи с этим был изменен генеральный план города, что вызвало волну протестов среди местных жителей. Копия документа была опубликована активисткой Яной Антоновой, в которой четко указано на размещение собора в зеленой зоне. Ранее эта территория считалась рекреационной и предназначалась для парков и скверов.
С 2021 года, когда власти впервые заговорили о строительстве храма, местные жители активно выступали против, ссылаясь на генплан. В августе 2024 года участок на набережной был выделен под храм, а губернатор Кубани Вениамин Кондратьев подтвердил, что «храму быть». В конце сентября на сайте администрации появился проект изменений в генплан, который был вынесен на общественное обсуждение на одну неделю вместо положенных двух месяцев.
Жители, недовольные изменениями, обращались к президенту Владимиру Путину и организовывали протесты, однако мэрия запретила митинги на набережной, предлагая проводить их в удаленных местах. Противники строительства сталкивались с давлением со стороны властей, в том числе задержаниями активистов. Тем не менее, новый генплан был принят большинством голосов депутатов городской думы в ноябре.